根治毛囊炎需积极治疗及去除诱因。患者可在清洗面部皮肤后外用20%鱼石脂软膏、3%碘酊，但由于刺激性较强，不可用于破溃处。此外需口服头孢地尼、阿奇霉素、左氧氟沙星等抗生素抑制皮肤感染，也可合并外用莫匹罗星软膏。如炎症持续发展且内部脓性物较多，则可经专业医师切开脓肿部位引流。此外如频繁复发也可使用激光破坏毛囊。患者自身也需注意清洁面部，减少食用油腻荤腥及辛辣刺激性食物，避免面部毛孔油脂分泌增多诱发感染。