孕妇卵巢囊肿处理如下：1*如果囊肿小于5厘米且不伴有症状，一般是可以不做治疗的，定期检查即可。2*如果妊娠早期囊肿较大，建议等到妊娠三月后，再进行手术治疗。此时做手术可以降低流产几率。3*如果在怀孕期间发生严重腹痛，考虑是由于卵巢囊肿破裂或是扭转引起的，建议及时住院治疗，必要时进行开腹手术。注意术后要多休息，多吃营养丰富的食物，保持心情舒畅，定期检查。