运动康复师证发证机构是指负责颁发运动康复师资格证书的组织或部门，在中国，运动康复师证发证机构主要包括以下几个部门：

1、国家卫生健康委员会(National Health Commission of the People's Republic of China,简称NHC):NHC是中华人民共和国国务院组成部门，主要负责制定和实施卫生政策、法规和标准，监督和管理全国卫生工作，NHC下属的国家卫生健康委员会人才交流服务中心(以下简称人才中心)负责全国范围内的人才培训、考试、证书颁发等工作，NHC是运动康复师证发证的主要部门之一。

2、中国康复医学会(Chinese Society of Rehabilitation Medicine,简称CSM):CSM是中国康复医学领域的专业学会，成立于1981年，作为国家级学术组织，CSM负责制定康复医学领域的行业标准、技术规范和教育培训等内容，CSM旗下设有职业能力评价与认证中心，负责运动康复师等相关职业的能力评价、培训和证书颁发工作。

3、中国职业技能鉴定指导中心(China Vocational Skills Assessment and Guidance Center,简称CVSAC):CVSAC是人力资源和社会保障部直属事业单位，主要负责职业技能鉴定、技能培训和证书颁发等工作，CVSAC作为运动康复师证发证的另一个重要部门，与中国康复医学会合作，共同推动运动康复师职业能力的评价和认证工作。

4、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各级卫生健康委员会在国家卫生健康委员会和中国康复医学会的指导下，负责本地区运动康复师的培训、考试和证书颁发工作，各地卫生健康委员会下设的职业技能鉴定机构，负责组织运动康复师等相关职业的能力评价和证书发放。

5、地方职业技能鉴定机构：除了中央和省级卫生健康委员会设立的职业技能鉴定机构外，各地还设有地方职业技能鉴定机构，这些机构负责组织本地区的运动康复师等职业的能力评价和证书发放工作。

6、其他相关行业协会和社会组织：如中国体育科学学会、中国残疾人联合会等，这些协会和社会组织在运动康复师培训、考试和证书颁发方面也发挥着重要作用。

运动康复师证发证机构主要包括国家卫生健康委员会、中国康复医学会、中国职业技能鉴定指导中心以及各级卫生健康委员会等相关部门，这些部门共同推动运动康复师职业能力的评价、培训和证书颁发工作，为广大运动康复师提供权威、专业的职业发展支持。