心理咨询师证书发放机构是哪个部门的，这个问题涉及到心理学专业领域的知识和政策，在中国，心理咨询师证书的发放主要由两部分组成：培训和考试，以及颁发证书的机构。

我们需要了解心理咨询师的培训和考试，为了成为一名合格的心理咨询师，需要参加专业的培训课程并通过考试，这些培训课程通常由各大高校的心理学专业开设，如北京师范大学、华东师范大学等，在完成培训课程后，学员需要参加由中国心理卫生协会(CPA)组织的心理咨询师资格考试，通过考试后，学员将获得心理咨询师资格证书。

负责颁发心理咨询师证书的机构是什么呢？在中国，这个机构就是中国心理卫生协会(CPA)，中国心理卫生协会是一个全国性的专业性社会组织，成立于1953年，它是中国心理学界的权威组织之一，负责制定心理咨询行业的标准和规范，组织和开展心理咨询师的培训和考试工作，以及对心理咨询师的专业资格进行认证。

除了中国心理卫生协会外，还有其他一些部门和机构也参与到心理咨询师证书的发放工作中，各省、市、自治区的心理卫生中心或者精神卫生中心，也会承担一部分心理咨询师证书的发放工作，这些中心通常是由政府资助的非营利性机构，负责为本地区居民提供心理健康服务。

心理咨询师证书发放机构主要是由中国心理卫生协会(CPA)负责，但各省、市、自治区的心理卫生中心或者精神卫生中心也可能参与到其中，希望我的回答能够解答您的疑问，如果您还有其他问题，请随时提问。