心理咨询师证书发放机构是指负责管理和监督心理咨询行业发展的政府部门或专门的机构，在中国，心理咨询师证书发放机构主要是由国家卫生健康委员会(简称国家卫健委)和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会(简称卫健委)共同负责，还有一些行业协会和专业组织也会参与心理咨询师证书的发放和管理工作。

国家卫生健康委员会作为中国政府的主管部门，负责制定和实施全国范围内的卫生健康政策、法规和标准，在心理咨询领域，国家卫健委负责制定心理咨询师职业资格认证的政策和标准，对心理咨询师的培训、考试、发证等环节进行统一管理，国家卫健委还会对心理咨询行业的发展进行指导和监督，确保心理咨询行业的健康有序发展。

各省、自治区、直辖市卫生健康委员会在国家卫健委的指导下，负责本辖区内的心理咨询师职业资格认证工作，各级卫健委会根据国家卫健委的政策和标准，组织本地区的心理咨询师培训和考试工作，对考试合格的学员颁发心理咨询师证书，各级卫健委还会对本地区的心理咨询行业进行监督管理，确保心理咨询师的专业素质和服务水平。

除了政府部门外，还有一些行业协会和专业组织参与心理咨询师证书的发放和管理工作，中国心理卫生协会(CPA)是一个在全国范围内具有权威性和影响力的心理卫生专业组织，负责组织和开展心理咨询师的培训、考试、资质认证等工作，还有一些地方性的心理咨询行业协会和专业组织，如北京心理学会、上海心理学会等，也在各自的地区内开展心理咨询师证书的发放和管理工作。

心理咨询师证书发放机构是由国家卫生健康委员会和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会共同负责的部门，同时也有一些行业协会和专业组织参与其中，这些机构的主要职责是制定和实施心理咨询师职业资格认证的政策和标准，对心理咨询师的培训、考试、发证等环节进行统一管理，确保心理咨询行业的健康有序发展。