健康管理师证考试科目包括基础知识和操作技能，两项考试时间均为120分钟，题型分为单选和多选，基础知识章节分值占比如下：第一章 健康管理概论 2-3分；第二章 临床医学基础知识 5-8分；第三章 预防医学基础知识 3-6分；第四章 慢性病 13-17分；第五章 流行病和医学统计学 9-12分；第六章 健康教育学 7-10分；第七章 营养与食品安全 5-8分；第八章 身体活动基本知识 7-10分；第九章 心理健康 4-6分；第十章 中医养生学基础知识 2-3分；第十一章 康复医学基础知识 3-5分；第十二章 健康信息学 7-10分；第十三章 医学伦理与职业道德 2-5分；第十四章 健康保险与健康管理 4-7分；第十五章 健康管理服务营销 3-5分。

操作技能考试包括“共用题干单项选择题”和“案例分析题”，共15大题，每题下面至少3小题，共58小题。“共用题干单项选择题”是医师考试中的配伍选择题，一大段材料是题干，下面配几个问题，均是单选，而“案例分析题”则是需要考生根据所给的病例进行分析和判断。