根据国家卫生健康委员会(以下简称卫健委)的相关规定，理疗师证书主要分为以下几种：

1、职业技能等级证书

职业技能等级证书是根据《职业技能等级标准》和《职业技能等级评价办法》制定的，是对从事某一职业的人员的技能水平进行评价的一种证书，理疗师职业技能等级证书分为初级、中级和高级三个等级，分别对应不同的技能水平，获得初级理疗师职业技能等级证书的人员可以从事一般的理疗工作；获得中级理疗师职业技能等级证书的人员可以从事较为复杂的理疗工作；获得高级理疗师职业技能等级证书的人员可以从事高级的理疗工作。

2、职业资格证书

职业资格证书是由国家人力资源和社会保障部颁发的，是对从事某一职业的人员的职业素质和能力进行评价的一种证书，理疗师职业资格证书分为初级和中级两个等级，分别对应不同的职业素质和能力，获得初级理疗师职业资格证书的人员可以从事一般的理疗工作；获得中级理疗师职业资格证书的人员可以从事较为复杂的理疗工作。

3、医学专业学位证书

医学专业学位证书是由国家教育部颁发的，是对医学专业毕业生学术水平和专业能力进行评价的一种证书，理疗师医学专业学位证书分为硕士和博士两个层次，分别对应不同的学术水平和专业能力，获得理疗师医学专业硕士学位的人员可以从事较为复杂的理疗研究工作；获得理疗师医学博士学位的人员可以从事高级的理疗研究工作。

4、执业医师资格证书

执业医师资格证书是由国家卫生健康委员会颁发的，是对具备一定医学知识和临床技能的医师进行资格认定的一种证书，理疗师执业医师资格证书是对其在理疗领域的医学知识和临床技能进行认定的一种证书，获得理疗师执业医师资格证书的人员可以在医疗机构中从事理疗工作。

5、中医康复治疗技术资格证书

中医康复治疗技术资格证书是由国家卫生健康委员会颁发的，是对具备一定中医康复治疗技术水平的人员进行资格认定的一种证书，获得中医康复治疗技术资格证书的人员可以在医疗机构中从事中医康复治疗工作。

6、物理治疗师注册证书

物理治疗师注册证书是由国际物理治疗协会(International Physical Therapy Association,简称IPTA)颁发的，是对具备一定物理治疗技术和知识水平的物理治疗师进行资格认定的一种证书，获得物理治疗师注册证书的人员可以在国际上从事物理治疗工作。

7、针灸推拿治疗师注册证书

针灸推拿治疗师注册证书是由世界针灸联合会(World Acupuncture and Moxibustion Federation,简称WAFME)颁发的，是对具备一定针灸推拿治疗技术和知识水平的针灸推拿治疗师进行资格认定的一种证书，获得针灸推拿治疗师注册证书的人员可以在国际上从事针灸推拿治疗工作。

卫健委承认的理疗师证书主要包括职业技能等级证书、职业资格证书、医学专业学位证书、执业医师资格证书、中医康复治疗技术资格证书、物理治疗师注册证书和针灸推拿治疗师注册证书等，这些证书分别对应不同的技能水平、职业素质、学术水平和国际认可程度，从业人员可以根据自身的实际情况和发展方向选择合适的证书进行考取和认证。