中医针灸师证办理机构备案是指在开展中医针灸师培训、考核、发证等活动时，需要向相关部门进行备案登记，根据《中华人民共和国中医药法》和《中医针灸师管理办法》的规定，中医针灸师证办理机构主要包括以下几种类型：

1、中医药院校：中医药院校是培养中医针灸师的主要场所，包括本科、专科和中专等各级各类中医药院校，这些院校在开展中医针灸师培训、考核、发证等工作时，需要向教育部门进行备案登记。

2、中医药培训机构：除了中医药院校外，还有一些专门从事中医针灸师培训的机构，如职业技能培训学校、继续教育机构等，这些机构在开展中医针灸师培训、考核、发证等工作时，也需要向教育部门进行备案登记。

3、中医药管理部门：各级中医药管理部门负责本行政区域内的中医针灸师管理工作，包括资格认定、考核发证、监督管理等，这些部门在开展中医针灸师证办理工作时，需要向上级主管部门进行备案登记。

4、其他相关机构：如卫生行政部门、人力资源和社会保障部门等，也可能涉及到中医针灸师证办理工作，这些部门在开展相关工作时，也需要向上级主管部门进行备案登记。

中医针灸师证办理机构备案的具体要求和流程可能因地区和部门的不同而有所差异，需要提供详细的办学资质、教学设施、师资力量等相关材料，经过审核批准后方可开展相关活动，还需遵守国家有关法律法规和政策规定，确保中医针灸师培训质量和证书的合法性。

需要注意的是，未经备案的中医针灸师证办理机构将面临一定的法律责任和处罚风险，建议广大从事中医针灸师培训、考核、发证等工作的机构和个人，务必严格遵守相关法律法规和政策要求，加强自身建设和管理水平，为推动中医药事业发展做出积极贡献。