中医针灸理疗师证的颁发部门有很多，其中比较权威的有国家中医药管理局、中国中医科学院、中华中医药学会等，这些部门都是在中医药领域有着较高声誉和影响力的机构，其颁发的证书具有较高的认可度和权威性。

国家中医药管理局是中华人民共和国国务院直属事业单位，负责全国中医药事业的管理和监督工作，该局下设多个司局，其中包括中医药管理司、中医药科技教育司、中医药人才教育司等，国家中医药管理局颁发的中医针灸理疗师证在全国范围内具有较高的认可度和权威性。

中国中医科学院是中国最高水平的中医药研究机构之一，也是国家中医药管理局直属事业单位，该院拥有众多知名的中医针灸专家和学者，其颁发的中医针灸理疗师证也具有较高的权威性。

中华中医药学会是一个专门从事中医药学术交流和科研工作的学术组织，其会员遍布全国各地，该学会颁发的中医针灸理疗师证在行业内具有一定的影响力和认可度。

无论选择哪个部门颁发的中医针灸理疗师证，都需要具备一定的专业知识和技能水平才能胜任相关工作，也需要关注各个部门颁发证书的具体情况和要求，以便更好地提升自己的职业素养和发展空间。