心理咨询师证的发放主要由国家卫生健康委员会负责，各省、自治区、直辖市也设有相应的鉴定机构，以下是具体的发放机构和流程：

1、国家卫生健康委员会(原卫生部):作为国家级的心理咨询师证书颁发机构，负责全国范围内的心理咨询师证书的审批、管理和监督，国家卫生健康委员会会定期组织心理咨询师资格考试，通过考试并符合相关条件的人员，可以申请领取心理咨询师证书。

2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各省、自治区、直辖市卫生健康委员会也会设立心理咨询师鉴定机构，负责本辖区内的心理咨询师证书的审批、管理和监督，考生在所在省、自治区、直辖市报名参加心理咨询师资格考试，通过考试并符合相关条件的人员，可以向所在地卫生健康委员会申请领取心理咨询师证书。

3、军队心理健康中心：军队心理健康中心作为军队系统的心理咨询师证书颁发机构，负责军队范围内的心理咨询师证书的审批、管理和监督，军队人员在军队心理健康中心报名参加心理咨询师资格考试，通过考试并符合相关条件的人员，可以领取军队心理咨询师证书。

4、社会组织和企事业单位：一些社会组织和企事业单位也会设立心理咨询师鉴定机构，负责本单位内部的心理咨询师证书的审批、管理和监督，这些组织和单位会组织内部培训和考试，通过考试并符合相关条件的人员，可以向鉴定机构申请领取心理咨询师证书。

心理咨询师证书的发放流程一般如下：

1、报名：考生需要在指定的报名时间内，向所在省、自治区、直辖市卫生健康委员会或军队心理健康中心报名参加心理咨询师资格考试，报名时需要提交相关材料，如身份证明、学历证明、工作经历证明等。

2、考试：考试通常分为笔试和面试两个环节，笔试主要测试考生的理论知识，面试主要测试考生的实践能力和沟通技巧，考试合格分数线由国家卫生健康委员会或各省、自治区、直辖市卫生健康委员会根据实际情况确定。

3、颁证：考试合格的考生，可以向所在省、自治区、直辖市卫生健康委员会或军队心理健康中心申请领取心理咨询师证书，颁发证书时需要查验考生的身份信息和相关证件，确保证书的真实性和有效性。

心理咨询师证的发放主要由国家卫生健康委员会、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会以及军队心理健康中心等机构负责，考生需要按照规定的流程和要求，参加考试并通过后，才能申请领取心理咨询师证书。