中医针灸师证书的颁发部门有很多，其中包括国家中医药管理局、各省市中医药管理部门、中医药院校等，这些部门颁发的证书都是正规的，但是不同的部门对于针灸师的要求和标准不同，所以在选择证书时需要根据自己的实际情况来选择。

如果您想要获得更加权威和专业的证书，建议您可以选择国家中医药管理局颁发的证书，这种证书不仅具有权威性，而且还能够更好地证明您在针灸方面的专业水平。

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