孩子发烧灌肠对身体会造成的危害有很多，首先是灌肠时使用的药物容易导致肠道菌群失调，使对肠道有益的益生菌排出，而且还容易诱发肠道感染，若是操作手法失误，容易对肠道粘膜及肛门部位等造成损伤，而且灌肠过程中会让孩子感到明显不适感染，所以孩子在发烧是灌肠不作为首选治疗方法，可以先通过物理降温，服用退烧药或通过静脉给药的方法来降温。