手上长扁平疣可用水杨酸软膏促进表皮脱落速度，用维A酸乳膏控制上皮细胞增长以达到治疗的目的，还可以应用重组人干扰素α-2b注射液抑制病毒复制，或是用咪喹莫特乳膏激活免疫细胞，其对于轻中度的扁平疣效果较好。扁平疣数目较少的患者，可考虑冷冻、电灼、激光或刮除治疗，如扁平疣数目较多的，建议可采取自体疣免疫法，能在体内产生抗病毒抗体从而有效降低复发率。