首先小便疼痛还流脓可能是淋球菌性尿道炎引起的，这种情况主要和患者不健康的性生活有关，最常见的症状就是小便疼痛，同时会伴随着尿道口出现黄色脓性分泌物。其次，非淋球菌性阴道炎也会导致患者出现小便疼痛还流脓的情况，这主要是感染支原体和衣原体引起的，患者还会出现尿道口瘙痒的症状，而且这种情况一般是白色分泌物。所以不论是哪种原因所致，建议患者前往医院的泌尿科治疗。