直肠疼痛要根据其病因来治疗，其可能是直肠炎引起。如果确诊为溃疡性直肠炎，需要使用美沙拉嗪药物进行治疗，同时还应使用糖皮质激素药物来进行保留灌肠。治疗期间应以低纤维、低脂以及高蛋白质饮食为主，还应保持肛周皮肤清洁干燥，大便之后可以用高锰酸钾溶液进行坐浴。直肠疼痛也可能是肛裂引起，建议您使用0.2%硝酸甘油以及钙通道阻滞剂进行治疗。