首先可以局部使用药物治疗，例如碳酸氢钠溶液清洗患处，或者是涂抹咪康唑、酮康唑、特比萘芬等药物，如果患者症状严重，还需要搭配全身用药，例如口服伊曲康唑、氟康唑等。另外，如果患者霉菌性龟头炎反复发作，可以直接手术切除包皮，有效的预防疾病复发。其次，霉菌性龟头炎最主要的治疗方法还是对因治疗，例如不洁的性生活引起的霉菌性龟头炎，则需要改善不恰当的生活习惯，性生活中做好安全措施等。