短期雾化治疗一般无明显副作用，对小孩呼吸道治疗有好处。由于孩子呼吸系统的纤毛发育不完全，用雾化器将药液分散成微粒，有利于孩子吸入，直接到达病原体进行治疗，减少药物在体内损耗。且比起口服或注射药物，没有痛苦，孩子更容易接受。但如果雾化使用的药物是激素类，长期使用容易引起口腔霉菌感染，如鹅口疮，还会刺激咽喉部，引发炎症、水肿等，以及对药物产生依赖性。