怀孕后有卵巢囊肿，首先需要观察囊肿的大小。如果囊肿的体积比较小，并且没有明显不舒服的症状，考虑为良性囊肿，不会对怀孕造成不利影响。患者只需定期复查就可以了，不需要进行特殊的治疗。如果囊肿的体积比较大，下腹部容易出现疼痛感，并且囊肿生长的速度也很快，容易占据腹腔内大量的空间，会对胎儿正常的生长发育情况造成不利影响，需要进行手术摘除。