角膜炎治疗常使用药物治疗，具体用药需根据角膜感染的病原体类型决定。细菌性角膜炎需使用广谱抗生素滴眼液抑制感染，同时需使用1%阿托品眼药水及依地酸二钠、半胱氨酸等药物减轻角膜胶原组织的溶解破坏以及预防虹膜与晶状体粘连。真菌性角膜炎则一般使用氟胞嘧啶＋两性霉素B、利福平＋两性霉素B等联合用药方案。病毒性角膜炎则除使用0*1%阿昔洛韦、0*05%环孢苷、0*1%碘苷、1%三氟胸腺密啶核苷酸等抗病毒滴眼液外，还常合并使用干扰素。