脚跟底疼的原因有：一、长时间进行运动，例如爬山、跑步等，导致脚底的肌腱和筋膜等组织受到反复摩擦，从而诱发无菌性炎症，引起疼痛。二、脚底存在骨刺，运动时压迫周围的组织，也容易出现症状。三、外伤，如果患者脚部受到外伤，导致部分软组织受损，甚至引起骨折等情况，也会出现不适。患者应该注意休息，如果存在炎症，应该积极进行抗炎治疗，如果与骨折有关，则需要进行手术。