新生儿结膜炎一般不会自愈，可能与沙眼衣原体感染有关，发病初期会表现为结膜水肿、充血，有脓性分泌物，严重者会出现角膜变暗、虹膜脱出，甚至失明，可以使用妥布霉素滴眼液、氯霉素滴眼液等进行治疗，还可以在睡前使用红霉素眼膏、四环素眼膏等进行治疗，如果伴随其他部位的感染也可以口服红霉素进行治疗，也有可能是单纯疱疹性结膜炎，可以使用三氟尿苷眼膏或眼液进行治疗，必要时需同时口服抗病毒药物治疗。