单纯就两者的潜在风险谈论，进行人工流产手术的伤害略大于服用紧急避孕药。紧急避孕药为利用较大剂量的雌孕激素抑制排卵及改变宫腔内环境以防止精卵结合，女性服用后一般仅可出现短暂时间的月经紊乱，待代谢完全后即可恢复正常。而人工流产则为利用器械抽取宫腔内的胚胎组织，术中不可避免会出现器械损伤，除可影响月经外，还可能继发妇科炎症。