患者睡起来头疼考虑是脑供血不足、植物神经功能紊乱、受凉感冒、高血压、睡眠质量不好等因素引起；或是患者患有颈椎病、神经衰弱、贫血等原因，都会引起头痛的发生。建议患者可以去去医院进行头颅CT、血常规、血压等相关检查，明确病因。若患者是因植物神经功能紊乱所引起，可以在医生的指导下使用安神补脑液、谷维素片、甲钴胺胶囊、维生素B等药物进行治疗，平时患者还要做好保暖措施。