第一，对其进行体格检查，例如使用棉球轻触患者咽部，查看患者是否有疼痛感。若疼痛明显，可同时进行局部麻醉，如果患者疼痛缓解，则可以判断是舌咽神经痛。第二，进行血常规检查，若血象明显升高，则可能是由感染而引起的舌咽神经痛。第三，对疑似舌咽神经痛患者进行头部的CT、X光或者血管造影等检查，判断是否是因为肿瘤或者血管压迫了神经而导致舌咽神经痛。