免疫系统疾病包括多种疾病，最常见、最严重危害人体健康的免疫系统疾病有系统性红斑狼疮，还有风湿免疫系统疾病，包括有类风湿性关节炎、风湿性关节炎等，这类的疾病是无法治愈的，此外还有自身免疫性血液系统疾病，原发性血小板紫癜、自身免疫性溶血性贫血等，还有溃疡性结肠炎以及IgG4相关的胰腺炎、胆管炎、甲亢、甲减、多发性硬化症、慢性肝炎、多发神经炎等。