肛裂患者可以选择肛裂切除术，或是侧位皮下内括约肌切断术的方式进行手术治疗。肛裂切除术适合慢性溃疡性肛裂患者，也就是肛裂底层和四周已经出现瘢痕组织，但是长期非手术疗法无效的患者。或是适用于肛乳头肥大、前哨痔以及肛瘘患者。侧位皮下内括约肌切断术适用于单纯性肛裂、便后剧痛或是伴有肛管括约肌痉挛的患者，其中手术步骤包括后位侧位皮下内括约肌切断术、位侧位皮下内括约肌切断术、内括约肌切断术三种。