系统性红斑狼疮会导致肾脏器官的并发症，如肾炎、肾血管病变等，患者主要表现为蛋白尿、血尿、高血压等。还可能会导致其他泌尿系统疾病，如输尿管扩张、膀胱炎等。此外会引起心血管疾病的发生，如心包炎、心肌梗死、心力衰竭等。如果累及肺组织器官，患者会出现胸腔积液、肺动脉高压、机化性肺炎等，患者在治疗期间服用药物时，容易发生肺部感染的情况。其次会引起肠出血、眼底出血等症状。