子宫内膜异位症最常见的症状是痛经，一般月经前一至两天疼痛严重，然后逐渐缓解，腰骶部以及下腹深部疼痛明显，可向肛门及会阴处放射。部分患者还会出现月经周期延长、月经点滴出血、月经量增多甚至是不孕等症状。子宫内膜异位症可长在卵巢、肠道、膀胱、输尿管等不同部位，位置不同期相应临床症状也不同。肠道内子宫内膜异位可出现便秘、腹痛甚至是便血等症状，如果是膀胱内异症，患者会有排尿频繁、疼痛、血尿等表现。