四十天的宝宝咳嗽首先要带孩子到医院儿科详细的检查一下，找出确切的病因后对因治疗。如果是普通感冒引起的，适当给宝宝服用感冒药和止咳的药物就可以了，如小儿止咳糖浆、小儿感冒冲剂、雪梨止咳口服液等。如果是细菌感染导致的支气管炎、肺炎等疾病引起的，要根据药敏试验，在医生指导下选择致病菌敏感的抗生素进行治疗，如青霉素类、大环内酯类、头孢菌素类等。