阴茎短小如果是由于睾酮激素水平降低引起的，可以服用激素药物进行治疗，常用的药物有绒毛促性腺激素、促性腺激素释放激素、睾酮等。如果药物治疗效果不佳的患者，可以通过手术治疗，主要适用于勃起长度小于7厘米的患者。常用的手术方式为阴茎延长手术、阴茎假体植入术，但是具有一定的副作用，手术后可能会影响到正常的性生活。如果是肥胖导致阴茎短小，需要适当的减肥。