发烧的时候出现两边肾脏部位有疼痛感的现象，通常是因为患有肾脏方面的疾病引起的，例如患有肾小球肾炎、肾盂肾炎、肾病综合征等疾病，也不排除是患有肾结石、肾脏肿瘤等疾病造成的。患者近期可以到医院进行双肾彩色多普勒超声等检查，从而明确病因。除此之外，患有肾囊肿等疾病也会引发这种症状。若是因为患有肾炎所致，则建议患者遵医嘱使用糖皮质激素类的药物进行治疗，也可以进行血液净化治疗。