孕5个月肚子隐隐作痛的原因有很多，有可能是肠道的问题，饮食不当，使大便出现异常，肠道蠕动出现疼痛感。此外还有可能是先兆流产，先兆流产常表现为阴道出现少量流血，接着会出现腰痛与下腹痛，如果有以上症状，需要立即去产科就诊。另外有可能是情绪紧张导致的神经痛，放松情绪、转移注意力后会缓解。日常注意饮食健康，养成定时排便的习惯，孕期注意情绪放松、愉悦，避免紧张、焦虑，按时产检。