治疗萎缩性肺炎可以先消除病因，一般是由幽门螺旋杆菌引起，所以要先去医院进行针对性的治疗，并且要避免一些诱发因素，比如生活上的不良习惯，尽量保持身心愉悦，减少不良情绪，同时需要避免辛辣刺激、粗糙的食物，不可以抽烟喝酒等。另外要增强胃黏膜的抵抗能力，需要遵医嘱服用保护胃黏膜的制剂，可以有效的改善腹胀的症状，并且还能预防胆汁反流。如果萎缩伴有异性细胞增生，则还需要预防癌症的出现。