药物流产后清宫是会有一定的疼痛感的，但是这种疼痛都是可以忍受的。因为在服用了流产的药物之后宫口处于松弛的状态，所以在手术过程中无需再次扩张宫口，且在药流的时候会伴有宫缩的症状，所以此时做清宫对疼痛程度已经有了耐受，因此药流后清宫的疼痛感不会很强。如果是自身耐痛性差，对疼痛很敏感，可以选择做无痛清宫，由于给予了麻醉，所以整个手术过程疼痛程度较小。