怀孕四十天的孕妇可以选择药物流产或者是人工流产的方式终止妊娠，药物流产适用于无生育史的孕妇并且成功率也相对较高，有孕产史的孕妇建议进行人工流产，以免药流不全需二次刮宫。另外，流产前需要患者先进行B超、血液化验等相关检查，确认孕囊大小后采取合适的方法终止妊娠，若孕囊小于或等于十五毫米时即可进行流产。流产后注意腹部保暖，避免受凉，一个月内夫妻禁止同房，以免造成感染。