附件囊肿患者能否怀孕取决于囊肿的发展进程及性质等，若其囊肿为生理性囊肿且体积较小、发展速度较慢，则一般并不影响怀孕，但若囊肿为病理性囊肿、体积较大、发展较快且存在一定的癌变风险，则一般其内分泌可有明显紊乱，可能无法自然受孕。再者，即便其受孕也无法正常妊娠、分娩，并可影响母体的治疗进程及用药。建议患者可优先治疗疾病，待囊肿基本消失后再行备孕。