想要根除灰指甲需要彻底的清除真菌感染，首先可以通过内外用药治疗进行抗真菌感染，一般可以口服盐酸特比萘芬片、氟康唑胶囊等药物，同时使用阿莫罗芬甲搽剂等药膏涂抹在患处，可以达到清除真菌感染的效果，但是一定要按疗程用药，并且需要坚持治疗直到彻底清除病灶，否则很容易复发。也可以通过外科手术拔出病变的指甲，消除病菌后让指甲重新生长达到根除灰指甲的目的。