鼻窦炎引起的头疼主要需治疗原发病，而该病症通常是由于患者鼻窦内部受到细菌、病毒等微生物感染所致，目前临床常用治疗方式是给予患者鼻内糖皮质激素治疗或多种抗生素药物治疗，效果良好，而若患者明确鼻内存在厌氧菌感染，则可合并甲硝唑使用。其次，轻微头疼者近期注意多休息可得到改善，而长时间头疼患者或疼痛感过于强烈，则可适当服用布洛芬等镇痛药物进行缓解。