糖尿病患者使用黄连素后可能有恶心、呕吐、皮疹、药热等表现，这些表现在停药后消失。有些患者可能伴迟钝、注意力不集中、疲乏无力、头晕、视力下降、排尿困难等不适表现，有些患者也可能不伴明显副作用。这种药物对多种革兰阴性菌、革兰阳性菌都具有抑制效果，对志贺菌属的抗菌效果比较强。如果患者使用黄连素后伴皮肤瘙痒、红肿等过敏反应，不可以使用此药物。