新生儿黄疸蓝光治疗有副作用，但是副作用比较小，治疗是比较安全的。蓝光治疗的副作用有：第一、治疗过程中容易引起皮肤灼伤，比如眼睛和会阴部的部位，导致皮肤脱水。在治疗前需要多给孩子喂温水，遮盖好孩子的眼睛、外阴部位，需要保持皮肤的清洁和干燥。第二、也可能会引起低热、腹泻、核黄素缺乏、钙缺乏、维生素B2缺乏等等。所以在治疗期间，出现这样的症状时，需要及时的给孩子补充铁剂、核黄素、维生素B2。