近视眼手术中，全飞秒和半飞秒的区别主要在于以下几点：一、手术设备不同，进行半飞秒时，需要使用两台机器，飞秒激光设备以及准分子激光设备。而进行全飞秒手术的时候，只需使用一台设备；二、手术切口不同，相比较而言，全飞秒手术的切口更小，切口大约只有两毫米左右，而半飞秒手术的切口大约有二十毫米左右；三、愈合时间不同，全飞秒手术后的伤口愈合时间更快。