咬合不正容易引起较多的并发症。首先咬合不正容易导致患者平时吃东西不方便和不易吞咽，时间长容易导致龋齿出现；咬合不正因为牙齿排列不整齐而导致刷牙不方面，牙齿清洁不畅，时间长有可能会引起牙周病；另外颞颚关节炎也是咬合不正患者经常出现的并发症；另外有咬合不正的患者，平时吃饭咀嚼不是很细，可能会导致胃肠道功能障碍，在临床也是常见的并发症；最后对于女性患者，因为咬合不正可能会影响到内分泌的正常功能，时间长不治疗可能会导致一些妇科疾病的产生。