药物流产孕囊排除不干净需要到医院进行人工流产，也就是通过清宫手术将残留的孕囊组织以及蜕膜组织清理干净，避免出现大出血、宫内感染等情况。一般药物流产后阴道出血的情况持续不会超过十天，出血量和正常月经量差不多。如何药物流产后阴道出血持续时间比较长，出血量也比较多，就考虑有孕囊排除不全或子宫复旧不良的情况，需要到医院做B超检查，明确诊断后采取合适的方法干预治疗。