马拉色菌毛囊炎在临床上主要可以使用抗真菌药物进行治疗。马拉色菌毛囊炎主要是由真菌感染导致的，一般情况下会选择外用的抗真菌药物进行局部涂抹治疗，常用的药物有酮康唑软膏、咪康唑软膏、克霉唑软膏等。其次，还需要和抗真菌的洗剂进行联合使用，常用的洗剂主要包括酮康唑洗剂、二硫化硒洗剂等。如果使用外用的药物没有明显的效果时，需要使用口服药物进行治疗，主要包括伊曲康唑、特比萘芬等。日常生活中避免辛辣刺激性的食物，保持皮肤表面清洁和干燥。