吃辣椒拉肚子的原因有以下几点：第一、因为摄入的辣椒较多，且辣椒比较辣，辣椒素较为丰富，对肠道进行强烈的刺激，从而导致肠道菌群失调，出现拉肚子。第二、患者本身患有肠胃部的疾病，如胃炎、胃溃疡等，食用辣椒之后，影响胃部功能正常，从而引起腹泻问题。第三、结肠只能怪存在辣椒素受体，当食用辣椒之后，辣椒中的元素会与结肠中的物质进行结合，从而导致受体激活，引起肠道系统紊乱。