三个月的宝宝咳嗽有痰可以在医生的指导下服用药物进行治疗，咳嗽有白痰一般为寒咳，可以口服杏苏止咳糖浆、风寒咳嗽颗粒等，咳嗽有黄痰多为热咳，可以口服小儿止咳有糖浆、鲜竹沥、小儿肺热咳喘颗粒等，如果孩子痰液较多可以配合口服乙酰半胱氨酸颗粒、盐酸氨溴索口服溶液进行化痰。平时要适当的增加室内的湿度，有利于稀释痰液，要及时将孩子呼吸道中的分泌物清理干净。