月经干净后第二天同房一般是不会怀孕的。这是因为如果女性月经周期规律，月经干净的第二天属于安全期，此时没有成熟的卵子排出，因此是不会怀孕的。但是其并不是绝对的，如果女性内分泌紊乱，月经周期不规律，也会导致卵子提前或者推后排出。如果同房时正好有卵子排出，则有怀孕的可能。建议女性在月经刚走时，避免性生活。因为此时宫颈口是没有完全闭合的。同房易导致细菌上行感染，导致盆腔炎、子宫内膜炎等妇科疾病。