无痛胃镜对身体是有较小的伤害的，无论是无痛胃镜还是普通胃镜对于上消化都会造成不同程度的创伤，主要会对咽喉部、胃粘膜、心肺功能产生一定的刺激作用，患者通常情况下会出现恶心、呕吐、腹痛等症状，这些症状一般在做完胃镜短时间内会自行缓解，对粘膜的伤害具有可修复性，患者不需要过多的担心。无痛胃镜需要在患者全身麻醉下进行，会有麻醉风险，对于心肺功能较差的患者不建议做无痛胃镜检查。