单纯疱疹与生殖器疱疹还是有区别的，首先感染的病毒类型不同，如果是单纯疱疹，是因为感染1型单纯疱疹病毒引起的，而且多发病于口腔黏膜。如果是生殖器疱疹，是因为感染2型单纯疱疹病毒引起的，发病部位主要是在外阴部位，部分患者可能会累及到肛门部位。其次两种疾病的诱发因素也有区别，如果是生殖器疱疹，与不洁的性生活有关，而单纯疱疹与免疫力低下、日常暴晒等因素有关。