食道溃疡通常是由于反流性食管炎、食管克罗恩病、药物性损伤等疾病所引起的，因此针对不同病因，采取的治疗方法不同。对于反流性食管炎，患者可以在医生指导下应用抑酸药物进行治疗，常用药物是质子泵抑制剂，可以较快缓解患者症状。对于食管克罗恩病，患者可以应用美沙拉嗪或其他免疫抑制剂进行治疗。对于药物性损伤引起的食管溃疡，大多数患者在停药后，便可以自行缓解。